Püha Miikaeli Koolil on aastas viis vaheaega.
2025/2026. õppeaasta koolivaheajad on järgmised:
I vaheaeg: 20. oktoober 2025 – 26. oktoober 2025;
II vaheaeg 22. detsember 2025 – 4. jaanuar 2026;
III vaheaeg 23. veebruar 2026 – 1. märts 2026;
IV vaheaeg (v.a 12. klass) 13. aprill 2026 – 19. aprill 2026;
V vaheaeg (v.a lõpuklassid) 10. juuni 2026 – 31. august 2026.